Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms