Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms