Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms