Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ciao1Q99KN2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms