Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms