Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed9Q99KF1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms