Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms