Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Ddb2Q99J79 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Ddb2Q99J79 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Ddb2Q99J79 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Ddb2Q99J79 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Ddb2Q99J79 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Ddb2Q99J79 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Ddb2Q99J79 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Ddb2Q99J79 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Ddb2Q99J79 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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