Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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