Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ttc30a1Q99J38 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc30a1Q99J38 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc30a1Q99J38 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc30a1Q99J38 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ttc30a1Q99J38 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc30a1Q99J38 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc30a1Q99J38 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc30a1Q99J38 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc30a1Q99J38 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc30a1Q99J38 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ttc30a1Q99J38 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ttc30a1Q99J38 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ttc30a1Q99J38 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ttc30a1Q99J38 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ttc30a1Q99J38 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ttc30a1Q99J38 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc30a1Q99J38 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms