Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sfxn4Q925N1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms