Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms