Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms