Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms