Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms