Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms