Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tdrd3Q91W18 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd3Q91W18 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms