Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx9Q91VH2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms