Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rhbdd2Q8VEK2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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