Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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