Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC66

Ssx2ip, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx2ipQ8VC66 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssx2ipQ8VC66 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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