Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpap2Q8VC34 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms