Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
ClmpQ8R373 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmpQ8R373 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms