Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms