Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Hecw1Q8K4P8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hecw1Q8K4P8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms