Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ssh3Q8K330 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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Ssh3Q8K330 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ssh3Q8K330 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ssh3Q8K330 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ssh3Q8K330 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ssh3Q8K330 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ssh3Q8K330 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ssh3Q8K330 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssh3Q8K330 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssh3Q8K330 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssh3Q8K330 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssh3Q8K330 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssh3Q8K330 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssh3Q8K330 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssh3Q8K330 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssh3Q8K330 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssh3Q8K330 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssh3Q8K330 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssh3Q8K330 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssh3Q8K330 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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