Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms