Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms