Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

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Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Snrnp27Q8K194 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Snrnp27Q8K194 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Snrnp27Q8K194 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Snrnp27Q8K194 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Snrnp27Q8K194 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Snrnp27Q8K194 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Snrnp27Q8K194 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Snrnp27Q8K194 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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