Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd1bQ8CFT2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms