Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Hpf1Q8CFE2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hpf1Q8CFE2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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