Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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