Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms