Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms