Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc27Q8CD92 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc27Q8CD92 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms