Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms