Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms