Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms