Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfibp1Q8C8U0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms