Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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