Protein–RNA interactions for Protein: Q8C503

Sit1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sit1Q8C503 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms