Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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