Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms