Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ube3dQ8BX13 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ube3dQ8BX13 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ube3dQ8BX13 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ube3dQ8BX13 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ube3dQ8BX13 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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