Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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