Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUE1

Slc9a4, Sodium/hydrogen exchanger 4, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a4Q8BUE1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc9a4Q8BUE1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc9a4Q8BUE1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms