Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp4aQ8BU40 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp4aQ8BU40 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms