Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubr7Q8BU04 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms