Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms