Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms